Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MLH3Q9UHC1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MLH3Q9UHC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MLH3Q9UHC1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
MLH3Q9UHC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms