Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
IFT172Q9UG01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
IFT172Q9UG01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT172Q9UG01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms