Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma4Q9R1P0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.7 ms