Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod2Q9R0B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod2Q9R0B9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod2Q9R0B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms