Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf346Q9R0B7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf346Q9R0B7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf346Q9R0B7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf346Q9R0B7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf346Q9R0B7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf346Q9R0B7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms