Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Limd1Q9QXD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Limd1Q9QXD8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1361.2 ms