Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC17A6Q9P2U8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A6Q9P2U8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms