Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SACSQ9NZJ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SACSQ9NZJ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms