Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
C9orf78Q9NZ63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
C9orf78Q9NZ63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
C9orf78Q9NZ63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C9orf78Q9NZ63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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