Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23BQ9NYZ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms