Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM28Q9NW13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM28Q9NW13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms