Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC17Q9NVM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJC17Q9NVM6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAJC17Q9NVM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms