Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLBQ9NRJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms