Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAR1AQ9NR31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAR1AQ9NR31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAR1AQ9NR31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms