Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM8Q9NQV8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms