Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms