Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPRD1BQ9NQG5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPRD1BQ9NQG5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms