Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SIX2Q9NPC8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIX2Q9NPC8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIX2Q9NPC8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms