Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A20Q9NP91 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A20Q9NP91 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A20Q9NP91 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A20Q9NP91 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms