Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdc42ep4Q9JM96 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep4Q9JM96 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms