Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabgef1Q9JM13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rabgef1Q9JM13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabgef1Q9JM13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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