Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgn5Q9JL35 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgn5Q9JL35 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms