Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmx1aQ9JKU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmx1aQ9JKU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmx1aQ9JKU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms