Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nova1Q9JKN6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nova1Q9JKN6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms