Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfra4Q9JJT2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfra4Q9JJT2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gfra4Q9JJT2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms