Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpf2Q9JJ80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpf2Q9JJ80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpf2Q9JJ80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms