Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smco4Q9JIS3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco4Q9JIS3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco4Q9JIS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms