Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LratQ9JI60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LratQ9JI60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LratQ9JI60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LratQ9JI60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms