Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pus3Q9JI38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pus3Q9JI38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus3Q9JI38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms