Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Exosc9Q9JHI7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Exosc9Q9JHI7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Exosc9Q9JHI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Exosc9Q9JHI7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms