Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAB2Q9HCS7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XAB2Q9HCS7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XAB2Q9HCS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAB2Q9HCS7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms