Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC24A3Q9HC58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC24A3Q9HC58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC24A3Q9HC58 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms