Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOD2Q9HC29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOD2Q9HC29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD2Q9HC29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms