Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNPO2LQ9H987 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2LQ9H987 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms