Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUDS3Q9H7L9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUDS3Q9H7L9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUDS3Q9H7L9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms