Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLMPQ9H6B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLMPQ9H6B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.1 ms