Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG9Q9H0W8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG9Q9H0W8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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