Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMEM39BQ9GZU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM39BQ9GZU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM39BQ9GZU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM39BQ9GZU3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms