Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLIRPQ9GZT3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLIRPQ9GZT3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLIRPQ9GZT3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms