Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Strn3Q9ERG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strn3Q9ERG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strn3Q9ERG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms