Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clstn2Q9ER65 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Clstn2Q9ER65 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Clstn2Q9ER65 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Clstn2Q9ER65 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms