Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spock2Q9ER58 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Spock2Q9ER58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spock2Q9ER58 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock2Q9ER58 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms