Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr6Q9EPW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr6Q9EPW9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr6Q9EPW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr6Q9EPW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms