Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb1Q9DAK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb1Q9DAK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms