Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ift43Q9DA69 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ift43Q9DA69 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms