Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms