Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c55Q9D816 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c55Q9D816 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c55Q9D816 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2c55Q9D816 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms