Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm5Q9D806 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms