Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl40Q9D783 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl40Q9D783 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl40Q9D783 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl40Q9D783 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms