Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce1Q9D720 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce1Q9D720 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce1Q9D720 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms